Mnogi naravni pesticidi so označeni kot varni za uporabo v ekološki pridelavi. Običajno so izdelani iz neke rastline ali iz katerega drugega naravnega materiala. V zemlji se razgradijo hitreje kot sintetični pripravki. Vendar pa samo zato, ker je nek pripravek označen kot naraven in primeren za ekološko pridelavo, še ne pomeni, da ni škodljiv za okolico, še zlasti pa ne za čebele.